Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37CA5D8V6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms