Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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