Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WWV3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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