Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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COL24A1Q17RW2 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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