Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DCLK3-201ENST00000416516 5344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CARD8-203ENST00000447740 5210 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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