Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYQ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYQ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYQ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYQ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYQ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms