Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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