Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms