Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1Q9UJ41 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1Q9UJ41 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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