Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms