Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP25Q9UHP3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms