Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms