Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms