Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms