Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBCCD1Q9NVR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms