Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC4Q9NTJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC4Q9NTJ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms