Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYTL1Q9NRR1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms