Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRDE2Q9H7Z3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms