Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms