Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms