Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms