Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms