Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms