Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP58Q9BVL2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms