Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms