Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms