Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms