Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms