Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R9BQ96SB3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms