Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms