Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms