Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCZQ96LD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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