Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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