Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC35A4Q96G79 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms