Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms