Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM63Q969Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms