Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR2Q969E8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR2Q969E8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms