Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN4Q92575 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms