Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms