Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms