Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms