Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRSK1Q8TDC3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms