Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYRIPQ8NFW9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms