Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms