Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms