Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2L2Q86YR7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2L2Q86YR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms