Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms