Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms