Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms