Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms